出纳在处理收款方式的差异性时，应该采取以下措施：
1. 根据公司内部的规定，明确不同收款方式的处理流程和账务处理方式。例如，现金收款应该及时存入银行，银行转账应该及时核对到账等。
2. 在收款时，仔细核对收款人的信息和收款金额，确保收款人和金额无误。
3. 对于不同的收款方式，应该建立相应的账户，并及时记录收款信息。例如，现金收款应该记录在现金账户中，银行转账应该记录在银行账户中。
4. 对于不同的收款方式，应该建立相应的收款凭证，并及时归档。例如，现金收款应该有相应的收据，银行转账应该有相应的银行回单。
5. 对于不同的收款方式，应该及时进行账务核对，确保账目准确无误。例如，对于银行转账，应该及时核对银行账户余额和银行流水账。

总之，出纳在处理收款方式的差异性时，应该严格按照公司内部的规定和流程进行处理，确保账务准确无误。