同一控制下合并是指母公司对其子公司拥有控制权，即母公司能够直接或间接地支配子公司的经营和财务决策。在这种情况下，母公司应该将其子公司的财务报表与自己的财务报表进行合并，形成一个整体的财务报表。

非同一控制下合并是指母公司对其子公司没有控制权，但是母公司对子公司有重要影响力，例如持有子公司的股份或者有重要业务关系。在这种情况下，母公司应该按照投资成本法对其子公司进行会计处理，即将投资成本与子公司的净资产合并计算，并在财务报表中披露相关信息。

总之，同一控制下合并和非同一控制下合并的主要区别在于母公司是否对其子公司拥有控制权，以及在会计处理和财务报表披露方面的差异。