电子银行承兑汇票背书转让的操作流程如下：
1. 首先，持有人需要将电子银行承兑汇票背书转让的意愿告知银行。
2. 银行会要求持有人填写转让申请书，并提供相关证明文件，例如身份证明、资金来源证明等。
3. 银行对持有人的身份和资金来源进行核实后，会在电子银行承兑汇票上注明转让人的姓名、转让日期和转让金额等信息，并将电子银行承兑汇票背书转让给受让人。
4. 受让人收到电子银行承兑汇票后，需要确认汇票的有效性和真实性，并向银行提交相关证明文件。
5. 银行对受让人的身份和资金来源进行核实后，会在电子银行承兑汇票上注明受让人的姓名、受让日期和受让金额等信息，并将电子银行承兑汇票背书转让给受让人。
6. 转让完成后，持有人和受让人都应该保存好相关证明文件和交易记录，以备日后查询和核对。