差额征税代发工资的会计处理如下：
1. 计算差额征税应纳税额：代发工资金额×（1-40%）×20%
2. 记录代发工资的借贷方向：

借：工资支出账户（或应付工资账户）

贷：个人所得税费用账户
3. 记录差额征税应纳税额的借贷方向：
借：个人所得税费用账户
贷：应交税费账户
4. 记录代扣代缴的借贷方向：

借：应付工资账户

贷：个人所得税费用账户

5. 记录代扣代缴的借贷方向：

借：应交税费账户

贷：银行存款账户

以上是差额征税代发工资的会计处理方法，需要注意的是，不同的企业可能有不同的会计处理方法，具体操作时需结合实际情况进行。