根据《企业会计准则》的规定，转让无形资产使用权应当分别计入以下科目：
1. 收到的对价或者收益，应当计入“其他业务收入”科目。
2. 转让无形资产所形成的差额，即转让价款与原无形资产账面价值之间的差额，应当计入“非流动资产处置净损失”或“非流动资产处置净收益”科目，具体取决于转让价款与原无形资产账面价值的大小关系。如果转让价款大于原无形资产账面价值，则计入“非流动资产处置净收益”科目；如果转让价款小于原无形资产账面价值，则计入“非流动资产处置净损失”科目。