购入汽车的车辆购置税应该分别按照以下会计分录进行处理：
1. 购置汽车的借方科目为“固定资产”，贷方科目为“银行存款”或“应付账款”（如果是分期付款购买）。
2. 车辆购置税的借方科目为“固定资产”，贷方科目为“应交税费”。

因此，整个购置汽车的会计分录应该如下：

借：固定资产
贷：银行存款（或应付账款）
贷：应交税费

注意：车辆购置税是一种应交税费，应该在购买汽车的同时进行核算和缴纳。购置税的税率是按照汽车的价格和税率计算的，具体的计算方法可以参考当地税务部门的规定。