企业缴纳残疾人就业保障金的计算方法如下：
1. 计算基数
企业应当根据上年度职工工资总额确定本年度的缴费基数。缴费基数的计算公式为：
缴费基数 = 上年度职工工资总额 × 残疾人就业保障金缴费比例
其中，残疾人就业保障金缴费比例为3%。
2. 计算应缴金额

企业应当按照缴费基数乘以残疾人就业保障金缴费比例计算应缴金额。例如，某企业上年度职工工资总额为100万元，那么缴费基数为100万元 × 3% = 3万元。该企业应当按照3万元 × 3% = 900元的标准缴纳残疾人就业保障金。