自然人独资企业需要交的税种包括：
1. 增值税：自然人独资企业按照增值税一般纳税人的标准进行纳税，需按照销售额的17%进行缴纳。
2. 企业所得税：自然人独资企业按照企业所得税的规定进行纳税，需按照纳税年度的利润总额的比例进行缴纳，税率为20%。
3. 个人所得税：自然人独资企业的所有者需要按照个人所得税的规定进行纳税，需按照所得额的比例进行缴纳，税率根据所得额不同而有所不同。
4. 城市维护建设税、教育费附加、地方教育附加税：自然人独资企业也需要缴纳这些税种，具体的税率根据地区不同而有所不同。

需要注意的是，自然人独资企业的税种和税率可能会因地区和行业的不同而有所差异，具体情况需要根据当地税务部门的规定进行缴纳。