电子银行承兑汇票过期后，应该按照以下步骤进行处理：
1. 核实过期日期：确认电子银行承兑汇票的过期日期是否已经到期。
2. 记录凭证：根据会计准则，应该在负债方面记载电子银行承兑汇票的未偿还金额，同时在损益方面计提坏账准备。
3. 通知出票人：向出票人发送通知，告知其电子银行承兑汇票已经过期，要求其进行清偿。
4. 处理清偿：如果出票人在通知后进行了清偿，应该在负债方面进行相应的核销处理。
5. 处理坏账准备：如果出票人未能进行清偿，应该根据公司的坏账准备政策进行相应的坏账准备处理。

需要注意的是，在处理电子银行承兑汇票过期的问题时，公司应该遵守相关的会计准则和法律法规，确保处理的合规性和准确性。