电子银行承兑汇票和商业承兑汇票的区别主要在以下几个方面：
1. 形式不同：电子银行承兑汇票是在电子银行系统中完成的，而商业承兑汇票是以纸质形式存在的。
2. 付款方式不同：电子银行承兑汇票是通过电子转账方式进行付款的，而商业承兑汇票是通过银行承兑、贴现、转让等方式进行付款的。
3. 使用范围不同：电子银行承兑汇票主要用于电子商务、网上购物等电子支付场景，而商业承兑汇票主要用于国内外贸易、投资等领域。
4. 监管机构不同：电子银行承兑汇票的监管机构是中国人民银行，而商业承兑汇票的监管机构是中国银行业监督管理委员会。

总的来说，电子银行承兑汇票和商业承兑汇票在使用场景、付款方式、监管机构等方面存在差异。