代垫的包装费应该根据具体情况分别计入以下科目：
1. 如果代垫的包装费是在采购商品时支付的，则应计入“存货”科目下的“商品成本”子科目中。
2. 如果代垫的包装费是在销售商品时支付的，则应计入“销售成本”科目下的“包装费用”子科目中。

需要注意的是，在计算企业的利润时，采购商品时支付的代垫包装费应计入商品成本，而销售商品时支付的代垫包装费则应计入销售成本。