销售部的折旧费用应该计入管理费用科目中的折旧费用。管理费用是指企业在日常经营活动中发生的与管理有关的费用，包括行政管理费用、销售费用、财务费用等。折旧费用是管理费用的一部分，通常是指企业固定资产在使用过程中由于使用、老化、损耗等原因而减少的价值，需要在会计上进行摊销，计入折旧费用科目。因此，销售部的折旧费用应该计入管理费用科目中的折旧费用。