商标注册费应当按照会计准则的规定，根据其性质和用途分别计入不同的科目。

具体来说，商标注册费属于一种无形资产的支出，应当根据其使用期限的长短分别计入资产或费用科目。

如果商标注册费用的使用期限超过一年，则应当计入无形资产科目，并在后续的会计期间中，按照其预计使用寿命的长短进行摊销。如果商标注册费用的使用期限不超过一年，则应当计入费用科目，并在当期确认为费用支出。

需要注意的是，商标注册费用的摊销应当根据商标的使用寿命和预计残值计算，摊销期限一般不超过商标的有效期限。同时，在商标注册费用的摊销过程中，如果商标的使用价值发生了重大变化，应当及时进行减值测试并进行相应的会计处理。