减免教育费附加是指企业在年度所得税申报时，可以依据国家有关规定，将其在当期应纳税所得额中扣除的教育费附加金额。具体做法如下：
1. 在会计科目中，将教育费附加的应交税金科目记为借方，教育费附加的费用科目记为贷方。
2. 在所得税费用科目中，将减免的教育费附加金额记为贷方。
3. 在所得税费用科目中，将应缴的教育费附加金额记为借方。
4. 在所得税费用科目中，将实际缴纳的教育费附加金额记为贷方。
5. 在所得税费用科目中，将减免的教育费附加金额与实际缴纳的教育费附加金额相减，得出应缴纳的教育费附加金额。

总之，企业应当根据国家有关规定，按照正确的方法计算减免教育费附加的金额，并在会计账簿中进行正确的记账处理。