单独支付的运费可以按照以下两种方式计入成本：
1. 加入到采购成本中：如果运费是在采购物品时单独支付的，可以将运费和采购价一起计入采购成本中。这样可以更准确地反映采购物品的实际成本。
2. 记为运输费用：如果运费是在采购物品后单独支付的，可以将其记为运输费用，作为销售成本中的一部分。这样可以更准确地反映销售物品的实际成本。

无论采取哪种方式，都需要在会计账簿中记录运费的详细信息，包括运费金额、付款日期、付款对象等。