工程利润率和毛利率都是企业经营管理中的重要指标，但它们的计算方法和涵义有所不同。

毛利率是指企业销售商品或提供服务所获得的毛利润与销售收入的比率，通常用来反映企业的经营效益和盈利能力。毛利率计算公式为：

毛利率 = （销售收入 - 销售成本）/ 销售收入 × 100%

其中，销售成本包括直接材料、直接人工和制造费用等。

而工程利润率是指企业在承接工程项目时，所获得的利润与工程总成本的比率，通常用来评估企业承接工程项目的盈利能力和风险控制能力。工程利润率计算公式为：

工程利润率 = （工程利润 / 工程总成本）× 100%

其中，工程总成本包括直接成本和间接成本等。

因此，毛利率和工程利润率的计算方法和涵义不同，需要根据具体情况选择适当的指标进行评估。