员工社保费用的预提和实际发生的差异可以通过以下步骤进行处理：
1. 首先，根据实际发生的社保费用，对应地进行会计分录的记账处理。
2. 其次，根据预提的社保费用，对应地进行会计分录的记账处理。
3. 最后，将实际发生的社保费用和预提的社保费用进行比较，计算出差异金额。
4. 对于差异金额，如果是实际发生的社保费用大于预提的社保费用，那么需要将差异金额作为费用进行记账处理；如果是预提的社保费用大于实际发生的社保费用，那么需要将差异金额作为收入进行记账处理。
5. 记账完成后，需要对账户余额进行调整，确保账户余额与实际情况一致。

需要注意的是，为了避免出现差异，预提的社保费用应该尽可能地准确。如果预提的社保费用与实际发生的费用存在较大差异，那么可能需要重新评估预提的金额，并进行相应的调整。