工程会计助理的主要工作内容包括但不限于以下几个方面：
1. 工程项目的成本核算：根据工程项目的实际情况，对工程项目的成本进行核算，包括直接成本和间接成本。
2. 工程项目的预算编制：根据工程项目的需求和要求，编制工程项目的预算，并进行预算控制。
3. 工程项目的结算：根据工程项目的实际情况，进行工程项目的结算，包括进度款的结算、完工结算等。
4. 工程项目的财务管理：对工程项目的财务状况进行管理和控制，包括资金的管理、成本的控制等。
5. 工程项目的报表编制：根据工程项目的需求和要求，编制工程项目的报表，包括成本报表、预算执行情况报表等。

以上是工程会计助理的主要工作内容，需要具备一定的会计专业知识和工程项目管理经验。