在公司办公楼装修的会计分录中，已经支付的装修费用应该按照实际支付的金额进行会计处理，而尚未支付的装修费用应该按照已经发生的费用进行会计处理。

具体分录如下：

已支付的装修费用：

借：装修费用 贷：银行存款

尚未支付的装修费用：

借：装修费用 贷：应付账款

当尚未支付的装修费用最终支付完成后，应该将应付账款减少，银行存款增加，具体分录如下：

借：应付账款 贷：银行存款

这样，就能够正确地处理已支付和尚未支付的装修费用的差异了。