代账公司会计助理需要掌握以下会计软件操作技能：
1. 会计软件的基本操作：包括软件的安装、启动、关闭、备份等。
2. 会计凭证的录入：代账公司会计助理需要掌握会计凭证的录入方法，包括借贷方科目的选择、金额的输入、附注的添加等。
3. 账簿的建立和维护：代账公司会计助理需要掌握账簿的建立、账户的设置、科目的调整等操作。
4. 报表的生成和分析：代账公司会计助理需要掌握报表的生成方法，包括资产负债表、利润表、现金流量表等，以及对这些报表进行分析和解读的能力。
5. 税务申报：代账公司会计助理需要掌握各种税务申报表的填报方法，包括增值税申报、所得税申报等。
6. 数据备份和恢复：代账公司会计助理需要掌握数据备份和恢复的方法，以确保数据的安全性和完整性。

除了以上技能，代账公司会计助理还需要具备良好的沟通能力、团队协作能力和解决问题的能力，以便与客户和团队成员进行有效的沟通和协作，解决会计实务中遇到的问题。