在承兑汇票贴现协议中，贴现利率通常由以下因素决定：
1.市场利率：贴现利率通常受市场利率的影响。市场利率越高，贴现利率就越高。
2.汇票到期日：汇票到期日越远，贴现利率就越高。因为贴现人需要考虑时间价值的影响。
3.汇票金额：汇票金额越大，贴现利率就越低。因为贴现人愿意为大额汇票提供更低的贴现利率。
4.贴现人的信用评级：贴现人的信用评级越高，贴现利率就越低。因为贴现人的信用评级越高，贴现人的风险越小。

综合考虑以上因素，贴现人和持票人可以协商确定一个合理的贴现利率。