企业注册时认缴出资时间的确定方式有以下几种：
1. 根据公司章程约定的认缴出资时间；
2. 根据出资人与公司之间签订的出资协议约定的认缴出资时间；
3. 根据公司与出资人之间签订的认缴出资书面确认的认缴出资时间；
4. 根据公司与出资人之间签订的其他书面协议约定的认缴出资时间；
5. 根据公司实际收到出资款项的时间确定认缴出资时间。

以上是常见的认缴出资时间的确定方式，企业在注册时应当根据实际情况选择合适的方式确定认缴出资时间，并在公司章程或其他相关协议中进行约定。