第三方审计收费的计费方式通常有以下几种：
1.按照工时计费：按照审计人员的工作时间计费，通常按照每小时的费用计算，费用根据审计人员的级别和经验而定。
2.按照固定费用计费：按照合同约定的固定费用计算，通常根据审计项目的复杂程度、规模和风险等因素而定。
3.按照项目百分比计费：按照审计项目的总费用的一定比例计算，通常根据合同约定的比例计算。
4.按照成果计费：按照审计项目的成果计算，例如发现的问题数量、提出的改进建议等。
5.混合计费：以上计费方式的组合，根据具体情况而定。

需要注意的是，不同的审计公司和项目可能采用不同的计费方式，具体计费方式应根据合同约定确定。