工会经费的缴纳方式主要有以下几种：
1. 扣款方式：由企业在员工工资中直接扣除工会会费并代为缴纳。
2. 现金缴纳方式：员工自行到工会缴纳会费。
3. 转账方式：员工通过银行转账的方式缴纳会费。

如何选择合适的缴纳方式，需要考虑以下几个方面：
1. 企业规模和员工数量：如果企业规模较大，员工数量较多，使用扣款方式会比较方便，而如果企业规模较小，员工数量较少，则现金缴纳或转账方式可能更为适合。
2. 员工意愿：如果员工对扣款方式存在疑虑或不愿意使用该方式，可以采用其他方式。
3. 工会规定：工会可能会对缴纳方式做出规定，企业需要遵守。
4. 成本考虑：不同的缴纳方式可能会产生不同的成本，企业需要考虑成本因素。

总之，企业需要综合考虑以上因素，选择最为合适的缴纳方式。