受托加工企业在委托加工业务中，应该按照以下步骤处理收入和成本：
1. 确定委托加工业务的合同金额，即委托方应支付的费用。
2. 确定加工成本，包括直接材料、直接人工、制造费用等。
3. 计算加工毛利润，即合同金额减去加工成本。
4. 根据合同约定，将加工毛利润分配给委托方和受托方。
5. 在会计账簿中，将收入记在“委托加工业务收入”科目下，将成本记在“委托加工业务成本”科目下。
6. 在利润表中，将加工毛利润计入“营业毛利润”科目下。

需要注意的是，受托加工企业在处理委托加工业务时，应该按照合同约定和会计准则的要求进行处理，并进行充分的凭证记录和核算。