小企业的短期投资主要包括银行存款、货币市场基金、短期债券等，处理这些账务需要注意以下几点：
1. 记录准确。在处理短期投资账务时，需要确保记录准确无误，包括投资金额、投资日期、投资期限、投资利率等信息。
2. 分类明确。不同类型的短期投资需要分别记录，以便于后续的核算和分析。比如银行存款和货币市场基金应分别记录在现金账户和投资账户中。
3. 及时调整。短期投资的市场价值会随着市场变化而波动，需要及时调整账面价值，以反映实际价值。调整的方法包括摊余成本法和公允价值法。
4. 定期核对。定期核对短期投资的账面价值和实际价值，以确保账面准确无误。
5. 注意税务影响。不同类型的短期投资可能会有不同的税务影响，需要根据具体情况进行处理。

综上所述，处理小企业的短期投资账务需要细心认真，确保记录准确、分类明确、调整及时、核对定期、注意税务影响。