小企业会计准则科目表与一般企业会计准则科目表的主要不同在于以下几个方面：
1. 科目设置不同：小企业会计准则科目表相对简化，只设置了必要的科目，而一般企业会计准则科目表则更为细致和繁琐，涵盖了更多的科目。
2. 记账方法不同：小企业会计准则允许采用单式记账法，即只记录一方账户，而一般企业会计准则则要求采用复式记账法，即同时记录借方和贷方账户。
3. 报表格式不同：小企业会计准则要求编制资产负债表、利润表和现金流量表，而一般企业会计准则则要求编制资产负债表、利润表、现金流量表和所有者权益变动表。
4. 会计政策选择不同：小企业会计准则允许企业根据自己的实际情况选择适合自己的会计政策，而一般企业会计准则则更为严格，要求企业按照规定的会计政策进行核算。

需要注意的是，小企业会计准则只适用于符合一定条件的小企业，而一般企业会计准则则适用于其他企业。