个人独资企业的经营所得税应按照以下步骤缴纳：
1. 首先，需要计算个人独资企业的应纳税所得额。计算公式如下：
应纳税所得额 = 经营收入总额 - 成本、费用、损失等支出 - 免征税所得额
2. 根据计算出的应纳税所得额，按照适用税率计算出应缴纳的税款。
3. 缴纳税款时，可以选择按月或按季度缴纳。按月缴纳时，应在当月的15日前将上个月的税款缴纳；按季度缴纳时，应在当季度的15日前将上一季度的税款缴纳。
4. 缴纳税款时，可以选择线上或线下缴纳。线上缴纳可通过网银、手机银行等方式进行；线下缴纳可到银行柜台、税务所等地点进行。

需要注意的是，个人独资企业应当按照税法规定，及时、足额地缴纳税款，否则将面临罚款等处罚。