保留意见的出现并不一定意味着被审计单位存在重大问题，但是它表明审计师在审核财务报表时发现了一些问题或者存在一些限制，从而无法对财务报表作出无保留意见的结论。保留意见通常会在审计报告的意见部分中详细说明具体的原因和范围。这些原因可能包括财务报表的编制方法、会计准则的适用、资料不足或者不完整、内部控制存在缺陷等。因此，被审计单位应该积极采取措施解决问题，以便在下一次审计中获得无保留意见的审计报告。