在企业合并时，如果涉及到非同一控制下企业，需要确定这些企业的公允价值。具体操作如下：
1. 首先，需要确定非同一控制下企业的净资产。
2. 然后，根据市场价格或者其他可靠的市场数据，确定这些企业的公允价值。如果市场价格不可用，可以采用其他估值方法，比如财务指标法、收益法等。
3. 接下来，需要计算出这些企业的差额，即公允价值与净资产的差额。如果公允价值大于净资产，说明这些企业存在商誉；如果公允价值小于净资产，说明存在减值。
4. 最后，需要按照合并后的股权比例，将这些企业的公允价值分配给各个股东。

需要注意的是，确定非同一控制下企业的公允价值是一个复杂的过程，需要考虑多种因素，比如市场环境、行业发展趋势、企业经营情况等。因此，在进行企业合并时，需要谨慎评估和确定非同一控制下企业的公允价值。