采购时的运费可以按照以下两种方式进行处理：
1. 归入成本
如果采购时的运费是由供应商直接收取的，那么这部分费用应该归入采购成本中。具体操作是，在采购发票上将运费单独列出，并与货物的采购价格一起计算入成本。
例如，一家公司采购了一批货物，货物的采购价为10,000元，运费为1,000元，那么在入库时应该将总成本计为11,000元。
2. 记入费用
如果采购时的运费是由公司自己支付的，那么这部分费用应该记入费用中。具体操作是，在支付运费时开具一张费用凭证，并将其记入相应的费用科目中。

例如，一家公司自己支付了1,000元的运费，那么应该在支付时开具一张费用凭证，并将其记入“运输费用”科目中。

需要注意的是，在实际操作中，应该根据具体情况选择采用哪种方式。如果采购的货物价格较高，而运费较低，那么将运费归入成本中可能会对成本计算产生较大的影响；而如果采购的货物价格较低，而运费较高，那么将运费记入费用中可能会更为合适。