小规模纳税人的增值税免税收入是指符合法定条件的销售额或者收入，不需要缴纳增值税。小规模纳税人在做账时，需要按照以下步骤处理免税收入：
1. 在记账时，将免税收入单独列出来，不计入营业收入总额。
2. 在会计凭证中，将免税收入记在“其他收入”科目下。
3. 在纳税申报时，将免税收入填写在“免税销售额”或“免税收入”栏目中。

需要注意的是，小规模纳税人的免税收入需要符合法定条件，如符合国家政策规定的生产、销售、服务等项目，才能享受免税政策。同时，免税收入的处理也需要遵循相关会计准则和税务法规。