如果普通发票是免税的，那么在记账时需要做出相应的分录。具体的分录如下：

借：应付账款（或者是其他应付款，根据实际情况而定）

贷：主营业务收入

其中，应付账款或其他应付款的金额应该与普通发票的金额相同，而主营业务收入的金额则应该是普通发票金额减去免税金额。

例如，如果普通发票的金额为1000元，其中免税金额为200元，那么相应的分录应该是：

借：应付账款1000元

贷：主营业务收入800元

需要注意的是，这只是一个基本的分录，实际情况可能会有所不同，具体的分录应该根据实际情况而定。