工会经费的计算方法因地区和企业不同而有所不同，但通常是按照员工实发工资的一定比例来计算的。这个比例通常是企业和工会协商确定的，并在企业内部制定了相应的规定。因此，如果企业规定按实发工资交纳工会经费，那么员工就需要按照实发工资的比例来缴纳工会经费。但如果企业规定按照其他方法来计算工会经费，员工就需要按照企业规定的方法来缴纳工会经费。