退税变成补税的原因可能有以下几种：
1. 错误的申报：企业在申报退税时填写的信息有误或者漏报了一些应纳税的项目，导致退税金额被计算错误，最终导致退税变成了补税。
2. 税务局的核查：税务局在核查企业的退税申报时发现了企业填报的信息有误或者存在不合规的情况，需要企业重新补缴相应的税款。
3. 法律法规的变化：税收政策和法规的变化也可能导致企业原本可以退税的项目变成了应该补税的项目。

如果企业发现自己申报的退税变成了补税，应该及时联系税务局了解具体情况，并且对自己的申报信息进行仔细核对和修正，以避免类似的情况再次发生。