支付年终奖的做账流程如下：
1. 根据公司的年终奖发放政策，计算每位员工的年终奖金额。
2. 在财务系统中开立一张付款凭证，填写付款金额、付款日期、收款人等信息。
3. 根据公司的财务管理制度，选择合适的付款方式（如银行转账、现金等），并将年终奖金额支付给员工。
4. 在付款凭证中记录付款的流水号、付款方式等信息。
5. 在账务处理中，将年终奖金额记入员工的工资账户，并在财务报表中进行相应的核算和汇总。

需要注意的是，年终奖的支付应该遵循公司的相关政策和法律法规，确保合法合规。同时，应该及时更新员工的工资账户，并在财务报表中准确反映年终奖的支付情况。