注册会计师审计和内部审计是两种不同的审计方式，其主要区别如下：
1. 审计目的不同：注册会计师审计是为了对公司的财务报表进行审计，以确定其是否真实、准确、完整地反映了公司的财务状况；而内部审计则是为了评估公司的内部控制制度是否有效，并提出改进建议。
2. 审计主体不同：注册会计师审计由独立的外部审计师进行，其独立性和客观性得到保障；而内部审计则由公司内部的审计人员或部门进行，其独立性和客观性可能受到公司内部的影响。
3. 审计报告不同：注册会计师审计生成的审计报告是向公司的股东、债权人、监管机构等外部利益相关方公开的，其内容包括审计师对公司财务报表的审计意见、审计程序和发现的问题等；而内部审计则向公司内部管理层提供审计报告，其内容包括对公司内部控制制度的评估和提出的改进建议等。
4. 审计时间不同：注册会计师审计通常在公司财务报表公布后进行，以确保报表的准确性；而内部审计则可以随时进行，以及时发现公司内部控制制度的问题并提出改进建议。

总之，注册会计师审计和内部审计都是对公司财务状况进行审计的重要手段，但其审计目的、审计主体、审计报告和审计时间等方面存在明显的区别。