水费差额征税是指将水费的征税对象由水费消费者转移到水费供应商，水费供应商需向税务机关缴纳增值税，因此水费供应商需要开具增值税专用发票。

具体操作步骤如下：
1. 水费供应商应当按照国家税务机关规定的税率计算增值税，然后将增值税计入水费账单中，向水费消费者收取水费。
2. 水费供应商应当在开具水费账单的同时，开具增值税专用发票，将增值税计入发票金额中。
3. 在开具增值税专用发票时，需要注意填写以下内容：
（1）发票抬头应当填写水费消费者的名称或者单位名称；
（2）发票内容应当填写“水费差额征税”；
（3）发票金额应当包括水费和增值税两部分。

以上是水费差额征税的开票方法，希望对您有所帮助。