劳务派遣公司差额征税是指劳务派遣公司在向客户提供劳务服务时，按照规定需要缴纳的增值税税额与扣除的增值税税额之差。对于差额征税的开票，应根据国家税务部门的相关规定进行操作。

具体操作步骤如下：
1. 在开具差额征税发票时，应注明“差额征税”字样。
2. 在发票上应明确注明劳务派遣服务的内容和金额，以及增值税税额和扣除税额。
3. 差额征税发票应按照正常的开票流程进行开具，并在税务部门进行纳税申报时，按照差额征税的规定进行申报。

需要注意的是，差额征税的开票和申报需要严格按照国家税务部门的相关规定进行操作，以避免出现税务问题。建议在开票和申报前，咨询专业的会计师或税务顾问的意见。