在途物资运费是指已经购买的但尚未到达企业仓库的物资，在运输过程中所产生的运费。根据会计准则，这部分费用应当计入“在途物资”成本中。因此，在途物资运费应当计入“在途物资”科目中，作为该科目的一部分成本。具体会计分录如下：

借：在途物资
贷：银行存款/应付账款

其中，银行存款或应付账款是支付运费的账户，根据实际情况选择相应的科目。