发放工资时需要扣除个人所得税，具体做账步骤如下：
1. 根据个人所得税法规定，确定每个员工的应纳税所得额和适用的税率。
2. 根据税率表计算每个员工的个人所得税应扣金额。
3. 在工资表中列出每个员工的应发工资和应扣个人所得税的金额。
4. 在会计账簿中分别记账，记应付工资和应交个人所得税两个科目。
5. 在支付工资时，先支付应扣个人所得税的金额，再支付应发工资的金额。
6. 在缴纳个人所得税时，将应交个人所得税的金额转入应交税费科目。

需要注意的是，个人所得税的计算和缴纳具有时限性，应按照规定的时间及时完成。同时，也需要根据税务部门的要求报送相关的报表和申报表。