工程上的设计费通常应该按照“费用”科目入账，具体操作如下：
1. 根据设计费的支付凭证，录入会计凭证，将设计费的金额借记“费用”科目。
2. 在“费用”科目下分录相应的明细科目，比如“设计费”等。
3. 根据设计费的支付凭证，将支付款项的金额贷记相应的银行存款科目。
4. 根据实际情况，可能需要在“费用”科目下分录相应的税金及附加科目。

需要注意的是，不同的公司可能对设计费的入账方式有所不同，具体应根据公司的会计制度和实际情况进行操作。