小规模纳税人汇算清缴是指年度汇总纳税申报，根据实际情况进行纳税调整，确定应纳税所得额和应纳税额，然后进行清缴。

具体操作步骤如下：
1. 准备资料：包括企业的财务报表、各项税费缴纳凭证及税务机关要求的其他资料。
2. 核对企业财务报表：核对企业财务报表，确保数据的准确性。
3. 核对各项税费缴纳凭证：核对企业所缴纳的各项税费，确保数据的准确性。
4. 计算应纳税所得额：根据企业财务报表和税法规定，计算企业应纳税所得额。
5. 计算应纳税额：根据应纳税所得额和税法规定，计算企业应纳税额。
6. 填写《企业所得税年度纳税申报表》：根据计算结果，填写《企业所得税年度纳税申报表》。
7. 缴纳税款：根据填写好的《企业所得税年度纳税申报表》，缴纳企业所得税。
8. 提交申报表：将填写好的《企业所得税年度纳税申报表》提交给税务机关。

需要注意的是，小规模纳税人汇算清缴的时间是每年的1月1日至5月31日。如果企业错过了汇算清缴的时间，将会被视为逾期申报，需要缴纳滞纳金。