计算应交税费和税金及附加的方法如下：
1. 确定税率：不同的税种有不同的税率，需要根据税种确定税率。
2. 确定计税基础：计税基础是指纳税人应纳税的货币金额，需要根据税种确定计税基础。
3. 计算应纳税额：应纳税额是指根据税率和计税基础计算出来的税款金额。
4. 计算应交税费和税金及附加：应交税费和税金及附加是指纳税人应该缴纳的税款金额，需要根据税种确定应交税费和税金及附加的具体内容。
5. 确定税款缴纳期限：不同的税种有不同的缴纳期限，需要根据税种确定缴纳期限。
6. 缴纳税款：在规定的缴纳期限内，将应交税费和税金及附加缴纳到税务部门指定的银行账户中。

需要注意的是，不同的税种有不同的计算方法和缴纳期限，需要根据具体情况进行计算和缴纳。同时，应及时了解税收政策的变化，避免因为不了解政策而产生税收风险。