小规模纳税人应交税费的二级科目包括：
1. 应交增值税：包括销项税和进项税。
2. 应交城建税：是根据城市建设和发展需要，由企业按照一定比例计算并缴纳的税费。
3. 应交教育费附加：是为了支持当地教育事业发展而征收的费用。
4. 应交地方教育附加：是为了支持当地教育事业发展而征收的费用。
5. 应交个人所得税：是指个人从各种来源获得的所得，按照规定的税率计算并缴纳的税费。
6. 应交企业所得税：是指企业从各种来源获得的所得，按照规定的税率计算并缴纳的税费。

以上是小规模纳税人应交税费的二级科目，具体缴纳标准和计算方法需根据当地税收政策和相关法规进行具体核算。