行政事业单位预算编制程序一般包括以下步骤：
1. 制定预算编制工作方案：确定预算编制的时间表、任务分工、预算编制的原则和要求等。
2. 进行预算调研：收集和分析行政事业单位的财务和经济数据，了解单位的收支状况、资产负债情况、经济运行状况等。
3. 制定预算指标：根据预算编制原则和要求，制定预算指标。预算指标应该具有可操作性、可比性、可控性、可评价性等特点。
4. 编制预算草案：根据预算指标，编制预算草案。预算草案应该包括预算总表、预算明细表、预算说明书等。
5. 审核预算草案：对预算草案进行审核，包括预算指标的合理性、计算的准确性、编制程序的合法性等。
6. 会审预算草案：召开预算会审会议，对预算草案进行审议和讨论，形成预算草案的最终版本。
7. 提交预算报告：将预算草案报送行政事业单位的领导机关或审批机关，经过审批后成为正式预算。
8. 实施预算控制：按照预算编制的指标和要求，对单位的财务运行进行控制和监督，确保预算的执行效果。