预付账款坏账准备的计提方法通常有以下两种：
1. 直接法：按照预付账款余额的一定比例计提坏账准备。比如，如果公司决定计提预付账款的2%作为坏账准备，则直接按照这个比例计提。
2. 间接法：按照预付账款的账龄分类，分别计提不同比例的坏账准备。比如，将预付账款按照账龄分为0-3个月、3-6个月、6-12个月和12个月以上四个档次，分别计提不同比例的坏账准备。一般来说，账龄越长，坏账准备比例就越高。

无论采用哪种计提方法，都需要根据实际情况进行调整，及时反映坏账准备的变化。