不能抵扣的增值税进项税额是指企业所购进的货物或接受的服务产生的增值税，但是由于该货物或服务用于非应税业务或者免税业务，无法抵扣的税额。处理方法如下：
1. 记录在成本费用中。将不能抵扣的增值税进项税额计入成本费用，作为该项业务的成本。
2. 记录在其他业务成本中。如果该项业务不属于主营业务，可以将不能抵扣的增值税进项税额计入其他业务成本中。
3. 记录在应交税费中。将不能抵扣的增值税进项税额计入应交税费中，作为企业应交的税款。

需要注意的是，对于不能抵扣的增值税进项税额，企业应当按照国家税务部门规定的要求妥善保存相关凭证和证明文件，并在税务申报时按照规定进行申报。