增值税减免税额的凭证制作步骤如下：
1. 在记账凭证上，将增值税销项税额和进项税额分别填入借方和贷方。
2. 根据国家税务部门的规定，确定该企业所享受的增值税减免政策，计算出减免税额。
3. 在记账凭证上，将减免税额填入贷方。
4. 根据凭证的金额，填写凭证号、日期、摘要等信息。
5. 审核凭证无误后，进行记账。
6. 在账簿上，将凭证的借贷方分别填入相应的科目账户中。

需要注意的是，减免税额的计算和凭证制作需要严格按照国家税务部门的规定进行，以避免出现税务风险。同时，企业还需要妥善保存相关凭证和税务文件，以备税务部门的查验。