村委会会计应该按照以下步骤处理村民捐赠的公益款项：
1. 首先，村委会会计应该开立一个专门的公益款项账户，将捐赠的公益款项存入该账户中。
2. 接下来，村委会会计应该将捐赠款项的来源、金额、用途等信息记录在记账凭证上，并按照规定的程序办理记账手续，确保记账凭证的真实性、准确性和完整性。
3. 在记账凭证上，应该注明该笔款项是公益款项，并说明该款项的用途，例如用于修建村民活动中心、购买救灾物资等。
4. 在每个会计期末，村委会会计应该编制公益款项的收支明细表，并在村委会的财务报表中披露公益款项的收支情况，以便村民和相关部门对公益款项的使用情况进行监督和审计。

总之，村委会会计在处理村民捐赠的公益款项时，应该遵循会计准则和相关法律法规，保证公益款项的使用透明、规范和合法。